Управление Учебным центром осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации и Уставом Учебного центра. В организации отсутствуют структурные подразделения. Непосредственное руководство Учебным центром осуществляет директор, который назначается в установленном порядке Учредителем.